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「第2話変人脳科学者VS蘇る美しき幽霊!! 脳トレで人は蘇る!?」視聴率22.0%

刑事の津村（神保悟志）と元鑑識課員の高田（福井博章）が相次いで殺されました。

現場にあった指紋は、津村と高田が担当捜査官だった事件の犯人のものと一致。

しかし、犯人だった竹神（Gackt）は、1年前に殺人罪で死刑になっていました。

話を聞いた九十九は、幽霊の仕業だと興味を抱き、殺人現場に出向きます。

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「第3話透明人間が仕掛けた連続殺人!! 脳トレが暴く透明の謎」視聴率16.3%

意識を失い倒れた九十九は、大学病院へ。やがて、病院の備品倉庫で外科教授・日向（品川徹）の遺体が見つかります。

監視カメラには、日向が倉庫に入って引き戸を閉めた後、誰もいないのに引き戸が開き始めた映像が残っていました。

九十九は”透明人間”の正体を解明するため、医師・和久井（亀梨和也）らに話を聞きます。

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「第4話変人脳科学者VS天才ピアニスト!! トランプで蘇る白骨死体!?」視聴率21.0%

記憶障害のあるピアニスト・優（まさる・佐藤健）が、姉・純（木村多江）の婚約者で弁護士の木下（貴山侑哉）を殺害した容疑で逮捕されました。

現場となった優の部屋からは優の指紋が付着したナイフが発見され、優のポケットからも”ぼくが殺した”という自供メモが見つかります。

興味を持った九十九は、現場を訪れます。

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「第5話変人脳科学者VS美しき多重人格者!! 結末は驚愕のアハ体験!?」視聴率18.5%

木下を殺害した犯人が別にいると考えた九十九は、捜査を開始。

優が記憶をとどめるために書いた譜面に残された四つの音符をヒントに、事件を解決へ導いていきます。

その後、都議会議員・百合子（大沢逸美）が射殺される事件が発生。

現場からは15年前に誘拐された10歳の少女の指紋が検出されます。

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「第6話変人脳科学者VS悲劇の多重人格トリック!! 脳トレは嘘発見器!?」視聴率18.9%

都議会議員・百合子に続き、島根で暴力団員が射殺されました。

現場で検出された指紋とDNAは、15年前に誘拐された10歳の少女・かなこのものと一致。

二つの事件を検証した九十九は、現在のかなこ（仲間由紀恵）の行動からかなこを多重人格者と疑い、和音（綾瀬はるか）らとともに島根の現場に向かいます。

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「第7話最終章〜変人脳科学者VS最強左脳男!! 脳内に時限爆弾」視聴率18.3%

科警研を訪れた警察庁副長官・川瀬（大林丈史）が入り口で銃撃されました。

近くのビルの窓にライフルが見え、丹原（香川照之）らはそのビルに向かいながら出口の封鎖を命じます。

しかし、九十九は、ライフルを目立つように置いたのは見せ掛けだと推理。

隣のビルから犯人が出てくると主張し、封鎖を要求します。

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「第8話（最終回）終幕〜さらば愛しの変人脳科学者!! 最後の脳トレは笑顔活用法」視聴率20.7%

九十九は、誘拐された衆議院議員・尾崎の息子、伸一郎（鈴木一真）のDNA調査を依頼しました。

採取したシェーバーに付く皮膚片のDNAは、傷つけた指先でハンカチに書いたと思われる印と一致。

しかし、伸一郎の指先に傷あとがなかったことを知った九十九は、違う人間でDNAが一致する可能性を考えます。